Relações: Pai – Dr. Katsuragi; Guardião de Shinji Ikari e Asuka Langley Soryu; Ex‑namorada de Ryoji Kaji; Amiga de Ritsuko Akagi; Proprietária do pen‑pen.

Misato Katsuragi ocupa o cargo de chefe de operações da NERV, iniciando como capitã e sendo posteriormente promovida a major. Ela comanda os pilotos da Eva no campo, dando ordens e traçando estratégias de batalha. Além disso, age como guardiã de Shinji e Asuka, permitindo que eles residam em seu apartamento em vez de viverem sozinhos.

Profissional e diligente nos deveres, ela se mostra desleixada e bêbada quando está de folga. Misato é a única sobrevivente da Expedição Katsuragi, o estudo científico conduzido por seu pai que desencadeou o Segundo Impacto; o pingente cruz que ela usa foi entregue pelo pai pouco antes de sua morte.

Ela e Ryoji Kaji foram amantes na faculdade e lentamente reacenderam o romance ao longo da série. Também era amiga de Ritsuko Akagi durante a universidade, e essa relação se desenrola à medida que Misato aprende mais sobre NERV e SEELE.