Watanuki é um estudante do ensino médio cuja vida tem sido difícil – não só seus pais morreram, obrigando-o a viver sozinho, mas ele também é atormentado diariamente por espíritos que apenas ele consegue ver (a habilidade de enxergá‑los e a razão dos ataques são traços hereditários; aparentemente o sangue dele atrai espíritos). Um dia, Watanuki faz um acordo com Yuuko para trabalhar para ela em troca do desejo de nunca mais ver espíritos. Isso marca o início do trabalho meio período, uma reunião fadada ao quarteto de Tsubasa: Reservoir Chronicle e a série de eventos “chance” que ocorrem não por coincidência, mas por “hitsuzen”.

Watanuki é conhecido por ter uma natureza volátil e carinhosa. Dependendo da pessoa com quem conversa, suas emoções tendem a ser exageradas. Com Himawari ele pula no ar acompanhado de corações e grita “Himawari‑chaaaaan!”. Com Domeki quase sempre expressa irritação com várias expressões faciais, gritos e movimentos de braço que lembram Himawari de um gato irritado. Exceto por esses dois e Yako, Watanuki costuma tratar todos ao seu redor com formalidade e bondade.

Um dos maiores problemas de Watanuki, especialmente no início do mangá, é a falta de autoestima. Ele não reconhecia nenhum valor em si mesmo e muitas vezes se sacrificava para ajudar os outros, mesmo que sua própria vida estivesse em risco. Um exemplo disso foi quando ele voluntariamente entregou o olho direito ao Grudge do Aranha para salvar o de Domeki, sem considerar como essa decisão poderia prejudicar Domeki. Ele é forçado a enfrentar esse problema tentando salvar o Zashiki‑Warashi do Joro‑Gumo; a matrona aranha o castigou duramente por não se importar consigo mesmo e com quem se importava dele. Diante dos fatos de como feriu aqueles ao redor, Watanuki começa a perceber algum valor em si próprio. Ele ainda usa suas habilidades muitas vezes para salvar os outros, mas agora está ciente do quanto suas ações machucam outras pessoas.

A vida de Watanuki muda significativamente quando ele começa a trabalhar como assistente de Yuuko (seu servo muito indignado contratado), que não só cozinha maravilhosamente, limpa diligentemente e reclama constantemente, mas também realiza trabalhos estranhos e aprende mais sobre o ocultismo.