Relações familiares e pessoais: pai, Dr. Katsuragi; guardiã de Shinji Ikari e Asuka Langley Soryu; ex‑namorada de Ryoji Kaji; amiga de Ritsuko Akagi; proprietária do Pen Pen.

Misato Katsuragi ocupa o cargo de chefe de operações da NERV, tendo iniciado como capitã e depois promovida a major. Ela é a comandante de campo dos pilotos da Eva, dando ordens e traçando estratégias de batalha. Além disso, age como guardiã de Shinji e Asuka, permitindo que eles residam em seu apartamento em vez de viverem sozinhos.

Profissionalmente, ela é dedicada e meticulosa; nas folgas costuma ser desleixada e beber bastante. Ela é a única sobrevivente da Expedição Katsuragi, estudo científico liderado pelo pai que provocou o Segundo Impacto; o pingente cruz que usa foi dado por ele pouco antes de sua morte.

Misato e Ryoji Kaji foram amantes na faculdade e gradualmente reacenderam o romance ao longo da série. Também era amiga de Ritsuko Akagi durante a universidade, e essa relação se desenvolve enquanto Misato aprende mais sobre NERV e SEELE.