Kohzou Fuyutsuki foi professor de metabiologia na Universidade de Kyoto e hoje ocupa o cargo de vice‑comandante da NERV sob a liderança de Gendo Ikari. Apesar da posição de comando, ele não tem formação militar; sua facilidade de liderar se deve mais à experiência acadêmica do que ao treinamento bélico. Em cenas reveladas no corte diretor, fica claro que Fuyutsuki recebeu algum tipo de instrução médica, mas nunca obteve licença ou a perdeu antes de iniciar sua carreira na academia. Ao longo da série não há menções a relacionamentos amorosos; ele parece ter permanecido solteiro o tempo todo.

Em flashbacks do episódio “O Nascimento da NERV”, alunos e o professor superior que lhe sugeriu aceitar Yui Ikari como assistente de pesquisa indicam que Fuyutsuki é mais sociável do que se imagina, embora mantenha um perfil acadêmico retirado. Assim que começou a trabalhar com Yui – em uma relação platônica e solidária – os superiores da instituição o direcionaram a firmar um acordo semelhante com Gendo Rokoboungi. As revelações posteriores sobre as maquinações de SEELE nas décadas anteriores mostram que Fuyutsuki já era alvo de monitoramento e recrutamento desde cedo.

Se a hipótese de Yui ter sido, na verdade, uma membro júnior da SEELE por influência de seu pai se confirmar, então a parceria entre Fuyutsuki e Gendo também teria sido planejada com antecedência. A introdução inicial de Fuyutsuki ao Rokoboungi/Ikari – levando-o como assistente de pesquisa, resgatando-o da prisão e encontrando-o novamente após o Segundo Impacto em uma expedição à Antártida – pode ser interpretado como um teste para avaliar sua confiabilidade, discrição e capacidade de compreender os objetivos da SEELE.

A avaliação de Fuyutsuki sobre a personalidade de Gendo Ikari, já evidente no corte diretor onde ele se refere ao líder como “verdadeiro bastardo”, foi reforçada pela missão antártica. Nessa viagem, o professor começou a suspeitar que os associados de Gendo na SEELE fossem mais poderosos e perigosos do que havia percebido inicialmente. Essa dúvida plantada durante a expedição levou à descoberta da verdadeira natureza dos eventos que culminaram no Segundo Impacto e ao envolvimento direto da SEELE na catástrofe.

Depois que Fuyutsuki ameaçou expor Gendo ao público em 2003, fruto de sua própria pesquisa sobre o impacto, o líder conduziu-o até o GeoFront e a Central Dogma, onde lhe revelou um protótipo incompleto do EVA. Nesse momento Ikari pediu a Fuyutsuki que se juntasse a ele para criar um novo futuro para a humanidade; o professor aceitou e começou a colaborar com Gendo. Não está claro se esse acordo foi motivado por idealismo ou autopreservação.

No filme “The End of Evangelion”, SEELE ameaça Fuyutsuki com “desaparecimento”, sugerindo que seu recrutamento pode ter sido uma escolha de Hobson. Apesar do ódio inicial de Fuyutsuki por Gendo, ele se torna o confidente mais próximo do líder ao longo da série. Em vários episódios, ele aparece como uma espécie de consciência externa para Ikari; embora um tanto rude, demonstra genuína preocupação com aqueles sob sua tutela e, ao conhecer os verdadeiros objetivos da SEELE para a Instrumentalidade, tenta equilibrar essa compaixão com a crueldade de Ikari em perseguir tanto a agenda da organização quanto o desejo de reunificar-se com Yui.

A dependência de Gendo em relação a Fuyutsuki como confidente e tenente chefe fica evidente nas inúmeras vezes que o professor age sem esperar instruções diretas. Embora tenha sido gentil e solidário com Yui, ele manteve postura profissional em todos os momentos; não há indícios de que o experimento Destrudo – que “matou” a jovem e ocultou sua alma na Unidade 01 EVA – tenha afetado seu comportamento.

A profundidade dos sentimentos de Fuyutsuki por Yui se manifesta quando, antes de desmaterializar-se em LCL durante a Instrumentalidade, ele testemunha uma imagem de Lilith‑como‑Yui flutuando para baixo e abraçando-o, oferecendo conforto enquanto ele transita para um estado não corpóreo.