Durante a Academia Militar, Tsubaki Yayoi era amiga próxima de Noel e Makoto. Ela é descrita como uma aluna “A”, muito séria e reservada, membro da respeitável família Yayoi.

No final do *BlazBlue: Trigger’s Calamity* (True Ending), Hazama a designa para matar Noel e Jin. Originalmente apareceu como personagem não jogável no Modo História de Trigger Calamity. Em BlazBlue, em turno contínuo, Tsubaki dirige-se à 13ª Cidade Hierárquica de Kagutsuchi para procurar Jin Kisaragi e Noel Vermillion. Ela utiliza um Ars Armagus chamado “Izayoi”. Quando encontra Jin, ele a aconselha a abandonar o Izayoi porque ele “rouba a luz dos olhos do usuário”, sugerindo que, após algum tempo, ela ficará cega.

Tsubaki revela ser fã de Hakumen, chegando ao ponto de possuir todos os livros e filmes sobre as façanhas dos Seis Heróis. No modo História de Hakumen, ele indiretamente revela que no passado ela foi sua secretária antes de Noel. Enquanto tinham mais tempo juntos, ele a negligenciou em favor de suas próprias conquistas; ela implorou para que permanecesse quando ele partiu, mas continuou, resultando em sua morte. Para lembrar o erro cometido, ele nomeou um de seus ataques em homenagem a ela.

Após a luta com Noel, Hazama diz a Tsubaki que, por causa da presença de Noel, ela assumiu o cargo de secretária de Jin, relegando Tsubaki às tarefas de assassinato. Já perdendo lentamente a visão devido ao uso excessivo do Izayoi, Tsubaki fica deprimida e zangada com Noel, acreditando que ele roubou tudo dela (embora Hazama tenha omitido que Tsubaki teria morrido de qualquer maneira na linha do tempo em que está com Jin). Hazama aproveita o surgimento dessas emoções para sua vantagem, fazendo Phantom usar sua feitiçaria sobre Tsubaki para manipular seu ciúme a seus próprios fins. O ponto crítico desse ciúme ocorre quando ela implora a Jin para recuar, dizendo-lhe que só queria estar com ele e que o desejo de Noel estava morto. Rejeitada por Jin, Tsubaki se alinha com Hazama e o Imperador, enquanto seus olhos tornam-se vermelhos e suas roupas brancas passam a ser pretas.