Genjuro alega ter matado sua família e pelo menos mil outras pessoas. Sua mãe era uma prostituta e ele não sabe nada sobre seu pai. No entanto, fez um juramento silencioso de cuidar dela até que seu pai voltasse para casa. Quando tinha 15 anos, Genjuro matou um homem que ficou em casa por causa da raiva bêbada do cliente. Enquanto ele se virava para deixar sua casa para sempre, a mulher o atacou enquanto amaldiçoava sua existência e deixou uma cicatriz em suas costas. Ele a matou em retaliação.

Genjuro é órfão e foi visto por Nicotine Caffeine, que o levou sob sua tutela junto com Haohmaru em sua casa. Ambos eram estudantes amigos próximos, mas a fome de poder de Genjuro preocupava Nicotina. Para testar seus alunos, ele os tentou a lutar pela espada preciosa Fugudoku. Eles foram testados enfrentando um grupo de outros lutadores. Genjuro matou seus oponentes durante a competição, acreditando que pessoas sem valor não merecem vida. Ele deixou o lugar de Nicotine com nojo depois deste evento.

Genjuro jurou matar Haohmaru e Nicotine, apesar das crenças idealistas deles sobre o jogo de espadas. Ele odeia Haohmaru especialmente porque ele se parece com o homem que estava com sua mãe quando os mataram. Genjuro também foi atraído por Shiki em um momento, pois ela se parecia com sua mãe.

Sua profissão durante suas viagens é ser um hitokiri ou assassino de aluguel, muitas vezes aceitando trabalhos sujos como eliminar brigadas de piratas e esconderijos de bandidos. Seus antigos clientes incluem Sankuro Yorozu e Mizuki Rashojin.

Em Samurai Shodown 64-2, Genjuro ganha a vantagem em seu último duelo com Haohmaru. Antes de dar o golpe final, um garoto o apunhala em vingança por seu pai desconhecido. Está fortemente implícito que Genjuro morre de sua ferida e, como prometido, um velho Haohmaru brinda à honra de seu amigo.

Genjuro é semelhante a Ukyo e acredita-se que sua morte seja reconduzida na nova sequência. Em outro momento, ele é atacado por dois assassinos, um mata rapidamente e o outro sobrevive. Antes de fazer o golpe mortal, o assassino sobrevivente diz que foi um teste de um homem chamado Golba e oferece-lhe para se juntar ao seu mestre.

Como ele hesita, o assassino se explode, o que favorece o interesse de Genjuro e começa sua jornada para encontrar Golba. Ele ainda está vivo em seu final e está em outro trabalho, como de costume.

Genjuro tem um lema que recita antes de matar pessoas: "Eu construo um ninho de feras em meu coração. A presa está rosnando, matar... Vamos matar. A presas está chorando, matar... Vamos matar. Para acalmá-lo, não tenho como senão cortar homens..." Embora seja mais exclusivo dos CDs de drama da série, os jogadores podem ouvir partes dele sendo cantado por uma mulher durante sua música tema em Samurai Shodown 64.

Genjuro é um guerreiro brutal que só luta pelo prazer de matar. Ele gosta de dominar os outros e odeia pessoas fracas. Há momentos em que ele ocasionalmente se arrepende e mostra misericórdia por suas ações, embora ele muitas vezes contrarie esses casos com mais atos de crueldade.

Ele é frequentemente chamado de "demônio" por suas vítimas, geralmente momentos antes de matá-los.