Nina Einstein aparece como uma estudante estudiosa no conselho estudantil da Ashford Academy. Ela reage com xenofobia intensa ao Onze e, quando Suzaku chega à escola, é intimidada por ele. Depois de ser ajudada pela Terceira Princesa Eufemia em um traumático caso de reféns no Lake Kawaguchi Convention Center Hotel, Nina desenvolve uma obsessão pela princesa e passa a contar com ela como apoio emocional.

Lloyd Asplund demonstra interesse na pesquisa pessoal de Nina sobre o uso do Urânio‑235 como combustível, fornecendo-lhe sakuradite para aprofundar seus estudos. Com a morte de Eufemia, Nina entra em colapso emocional e mental. Em uma tentativa equivocada de matar Zero e vingar a princesa, ela monta o quadro Ganymede Knightmare de Ashford com um protótipo de reator nuclear, planejando detoná‑lo para destruir Tóquio; porém não explode.

O Segundo Príncipe Schneizel recruta Nina como chefe da equipe de pesquisa “In Vogue”, sediada em Dallas, Texas. Ele a mantém estável lembrando‑a do comportamento de Eufemia, embora sua amargura por Zero permaneça. Sob sua liderança, ela finalmente cria uma bomba funcional: o F.L.E.I.J.A. Usado em Tóquio, ele oblita tudo dentro de oito quilômetros; outro na capital britânica Pendragon destrói tudo a 100 quilômetros de distância.

Nina fica devastada com a destruição causada por sua arma, que resulta em mais de 35 milhões de baixas quando disparada contra o Assentamento de Tóquio. Lloyd diz que ela terá que se afastar se quiser continuar como cientista. Logo depois, é obrigada a se esconder, pois vários países – inclusive Britannia – estão à procura dela por causa do envolvimento na criação do F.L.E.I.J.A. Ela e Rivalz são capturados por Lloyd e civis armados sob o controle de Lelouch Geass.