Kurisu Makise é a protagonista feminina da série e membro do Programa de Pesquisa do Cérebro na Universidade Victor Qondria. Sua faixa etária coincide com a dos estudantes do terceiro ano, mas ela pulou uma série no sistema educacional americano. Ela também ganhou notoriedade nos Estados Unidos por publicar artigos científicos, parte dos quais foi coberta pela imprensa.

Graças ao salto de um nível quando era menina, Kurisu atraiu inveja entre as pessoas ao seu redor e acabou construindo uma personalidade forte. Não quer mostrar fraqueza para os outros, então costuma ter uma expressão severa. No entanto, é extremamente curiosa; quando desperta interesse, investiga tudo com afinco. Ocasionalmente, tem opiniões que diferem das convicções comuns, como em “Os dados do experimento são mais importantes do que a privacidade do sujeito.” Rintarou costuma dizer: “Ei, você tem um bom senso de ser uma cientista louca”, mas ela não concorda com essas ideias pessoalmente. É considerada uma tsundere e recebeu vários apelidos de Rintarou, principalmente “Christina” (à direita) e “Assistente” (à direita).

Na linha do tempo Alfa, onde o SERN governa, Makise trabalhou para eles. Contribuiu significativamente para a conclusão da máquina do tempo do SERN e foi elogiada como “Mãe da Máquina do Tempo”. Na história lateral “The Far Valhalla”, que explora o destino de Kurisu, Okabe e Daru após serem capturados pelo SERN, revela-se que Okabe elaborou um plano para escapar da sede do SERN na França. Contudo, quando o SERN aprendeu que governaria o mundo no futuro, deixou Okabe e Daru seguir seu caminho para completar o ciclo do destino. Kurisu desistiu e ficou para trás, mas ainda acreditava que Okabe seria capaz de superar o destino. Em 2034 ela concluiu a máquina do tempo e foi executada pelo SERN. A lealdade de Kurisu ao SERN no futuro é a razão pela qual Suzuha, membro da resistência contra o SERN em 2036, inicialmente desconfiava dela; essa opinião mudou depois que aprendeu mais sobre a natureza de Kurisu.

Kurisu e seu pai não estão nas melhores condições. Quando pequena, as palestras do pai a fascinavam tanto que ela lia tudo sobre elas. Não demorou muito para entrar no campo da ciência. Por causa de seu talento, sempre foi mais esperta que seu próprio pai, fazendo ambos ficarem ruins. Kurisu desenvolve sentimentos por Okabe.