Ao começar a série, Kudō Shinichi tem 17 anos e frequenta a Escola Teitan. Já era reconhecido como um prodígio investigativo, chamado de “salvador” das forças policiais ao solucionar inúmeros casos que os profissionais não conseguiam desvendar.

Entretanto, durante a investigação de dois indivíduos enigmáticos, ele acaba sendo compelido a ingerir um veneno experimental chamado APTX 4869, provocando que seu corpo reduza‑se ao tamanho de uma criança de seis anos.

Adotando o pseudônimo Conan Edogawa — em homenagem a Arthur Conan Doyle e Edogawa Rampo — ele finge ser um parente distante de Agasa, colocando-se sob os cuidados de Ran. O pai de Ran, Mouri Kogorou, dirige uma agência de detetives que Conan aproveita para investigar casos ligados à Organização Negra.

Como Conan, Shinichi auxilia Kogorou na resolução de casos, colocando-o para dormir e imitando sua voz com um aparelho especial criado pelo Professor Agasa. Ao resolver caso após caso, ele contribui para a reputação do detetive, que logo passa a ser conhecido como “Kogorou Adormecido”.

Ele também dedica bastante tempo aos demais detetives, resolvendo inúmeros casos menores junto a eles e, por vezes, acompanhado pelo Professor Agasa. Conan permanece extremamente próximo de Ran, que, em retorno, demonstra grande proteção em relação a ele.

Como Ran desconhece sua verdadeira identidade, Conan frequentemente se vê em situações peculiares junto a ela — desde que ela lhe confessa sentimentos por Shinichi até momentos em que a mesma o faz tomar banho na fonte termal.

Mesmo reduzido a tamanho infantil, a sagacidade de Conan permanece inalterada. Tal como Shinichi, suas habilidades dedutivas o renderam apelidos como “Heisei Holmes” e “Salvador da Polícia Japonesa”.

Ele detém um vasto repertório de conhecimentos, desde temas complexos até curiosidades triviais, que lhe auxiliam na resolução de casos e na evasão de situações perigosas.

Quando interage com adultos, Conan costuma falar de forma infantil; porém, quando se envolve em um caso, ele acaba falando como adulto, abordando temas avançados e empregando raciocínio complexo demais para uma criança. Nesses momentos, tenta justificar dizendo que “ouvi na TV” ou que foi “ensinada pelo tio Kogoro/Professor Agasa/Shinichi‑niichan”.

Além disso, Conan não esconde seu afeto por Sherlock Holmes e pelo futebol; quando menciona algum tema em excesso, tenta disfarçar alegando ter sido informado por Shinichi.

Com o avanço da trama, os adultos ao seu redor passaram a aceitar sua inteligência infantil, permitindo que ele se comporte de maneira autêntica diante deles; contudo, ainda tenta disfarçar‑se como uma criança comum.

Conan mantém conversas profissionais apenas com alguns agentes: o FBI (notavelmente Jodie Starling), Shuichi Akai, James Black e o inspetor Kansuke Yamato da Polícia de Nagano; todos acreditam que há algo além do que aparenta em Conan.

Ele costuma ser autêntico ao lado dos Detetives Boys, embora pareçam estranhos quando ele age infantil diante de adultos. Frequentemente joga beisebol com eles; porém, sua familiaridade com o futebol lhe permite aplicar técnicas instintivas, como chutar bolas em situações que não exigem tal ação.

Como não conhece jogos populares nem programas de televisão e é ruim em videogames, Genta e os demais o consideram tolo. Essa situação irrita Conan, que então assiste à televisão em segredo na sala de estar após Kogoro e Ran dormirem, buscando mais “prática” interna.