Agarta, conhecida como Devoradora dos Dragões, tem a missão de eliminar as trevas—dragões serpentinos—que invadem as mentes das nações e corrompem sua consciência. Para isso, ela precisa sacrificar suas próprias memórias.

Em troca recebe lembranças antigas. Sua única companheira é um robô chamado 3‑5‑10, que a auxilia nas tarefas, mantém a nave em funcionamento e serve como repositório para preservar e organizar suas memórias.