Goemon é um homem de sangue quente oriundo de Edo. Com forte senso de justiça e determinação, ele corre atrás do que está errado diante dele, embora tenha temperamento curto. Ele tem uma namorada chamada Omitsu e melhores amigos/parceiros, entre eles Ebisumaru. Em vários jogos, Goemon aparece como personagem principal; sua arma favorita é um cachimbo no estilo antigo, que no anime tem acabamento dourado, mas em alguns jogos pode ser de madeira ou de prata. Dizem que ele foi inspirado em um verdadeiro ninja japonês chamado Shikawa Goemon, famoso por ter sido queimado vivo após uma tentativa fracassada de matar um senhor da guerra civil.