Natsume Takashi é o protagonista principal da série e, assim como sua avó falecida Natsume Reiko, tem a capacidade de ver ayakashi—espíritos que habitam nosso mundo. Ele herdou o Livro dos Amigos dela, um tomo que registra contratos vinculando os ayakashi à servidão quando são derrotados por Reiko.

Devido à forte semelhança física com sua avó, Natsume costuma ser confundido com ela e é perseguido por ayakashi que odeiam Reiko mas desejam o Livro dos Amigos. Para se livrar desses problemas, ele decide encerrar o livro devolvendo todos os nomes contratados aos antigos donos.

Ele conta com a companhia do youkai Madara, apelidado de “Nyanko‑sensei” (ou simplesmente “sensei”), que lhe promete posse do livro quando morrer. Em troca, a criatura deve servi‑lo como guarda‑costas até lá.

Órfão desde tenra idade, Natsume foi passado de parente para parente. Sua habilidade de ver e se comunicar com ayakashi o isolou da família e dos amigos durante a infância. Foi rotulado como mentiroso e “procurador de atenção” por tentar contar aos outros sobre os espíritos, e suas tentativas de fugir do youkai fizeram com que fosse chamado de louco. Assim, ele se tornou recluso na esperança de levar uma vida relativamente “normal” entre as pessoas.

Eventualmente, ele foi acolhido pelos Fujiwara, um casal de meia‑idade do lado paterno da família. Diferente dos parentes anteriores, eles realmente se importam com Natsume e ele os ama em troca. Ele não quer causar problemas, então o assunto dos ayakashi permanece secreto.

O poder espiritual incrivelmente forte de Natsume permite que ele bata e machuque youkai com facilidade. Ele desenvolve amizades tanto com youkai quanto com exorcistas, embora muitos busquem usá‑lo a seu favor. No anime, Natsume aparece mais alegre e de boa índole; no mangá, ele é um pouco mais sombrio e temperamental, especialmente em relação a Nyanko‑sensei.

Para cancelar os nomes inscritos no Livro dos Amigos, Natsume deve primeiro imaginar o ayakashi em sua mente para descobrir seu nome. O livro então se abre na página onde está escrito, que ele retira e coloca na boca enquanto expira. O feitiço que originalmente escravizava os espíritos utilizava saliva e respiração de Reiko; como neto dela e por ter forte semelhança com a avó, Natsume também pode usar o feitiço. No entanto, o custo de liberar cada nome é que sua energia fica quase completamente drenada no processo.