Ray Yuki é comandante da equipe ZAFT e trabalha em estreita colaboração com Patrick Zala, presidente do Comitê Nacional de Defesa. Quando Athrun estudou na academia militar ZAFT, Yuki foi seu mentor; agora que o jovem piloto retornou às instalações, cabe a Yuki informá‑lo sobre o fracasso da Operação Spit Break, o furto da Gundam Liberdade e a suposta traição de Lacus Clyne.