Nagisa Shiota é um dos estudantes da classe 3‑E. Por ser pequeno e ter habilidades físicas medíocres — quase tão frágeis quanto as de uma menina — ele costuma ser visto como o aluno mais fraco do grupo. Contudo, na verdade ele é o mais apto a se tornar um assassino entre todos os colegas, algo que tanto Korosensei quanto Karasuma reconhecem. Ele consegue se aproximar disfarçando sua sede de sangue para lançar ataques surpresa e faz com que os adversários vacilem apenas com essa vontade de matar.

Nagisa costuma anotar as fraquezas do professor; no início pareciam insignificantes, mas depois mostraram ser cruciais, já que uma delas coincide exatamente com a anotação dele, quase levando Korosensei à morte. Amigável e educado com todos, ele esconde um lado sombrio: como assassino, permanece invisível nas aulas diárias, revelando-se apenas nos treinos e em momentos de execução. Karasuma afirma que sempre que Nagisa demonstra a intenção de matar, não se trata de treino, mas sim de uma verdadeira matança.