Proto é o único membro bioróide da Seção 9 e já atuou como técnico de manutenção do Tachikoma (antes de se tornar um dos novos recrutas). Durante a crise de Dejima, ele desempenhou papel fundamental ao ajudar Aramaki a resgatar o primeiro‑ministro Yoko Kayabuki, que havia sido dispensado de suas funções e preso sob acusações de traição. Proto conseguiu acessar a rede e se comunicou com as unidades Tachikoma da Seção 9; por meio delas ele obteve plantas de construção e informações atualizadas sobre a operação Dejima, além da localização do primeiro‑ministro, antes que uma barreira de ataque o desativasse. Ele reaparece no filme *S.A.C.: Solid State Society* vestindo o uniforme preto da Seção 9 com uma arma, indicando que agora atua como oficial de campo.