Miyori tem 11 anos e mantém o coração fechado enquanto cresce em meio à discórdia dos pais. Quando sua mãe parte, ela se vê obrigada a morar na casa de seus avós numa aldeia remota por algum tempo. Embora seu pai ache que ficar no ambiente natural seja melhor do que a cidade, Miyori fica ainda mais obstinada, sentindo-se abandonada. Um dia, ao explorar as florestas próximas, ela presencia fenômenos misteriosos e encontra os espíritos da mata. Esses seres revelam que foi escolhida para ser a guardiã da floresta da aldeia. Inicialmente insegura, Miyori vai abrindo sua mente e se torna uma garota forte e responsável. Ela aprende a conviver com colegas de escola e com os espíritos, unindo forças contra quem planeja destruir a floresta ao construir uma represa.