Kabuto Yakushi nasceu em 29 de fevereiro, sexo masculino e sangue tipo AB. Na Parte I ele tem entre 19 e 20 anos; na Parte II, 23 a 24. Mede cerca de 176‑2 cm (Parte I) e 177 cm (Parte II), pesa 65 kg.
Parente adotiva: Nonou Yakushi, sua mãe. Sua natureza de chakra é libertação da terra e água.

Ele atua como o médico pessoal, assistente e principal braço direito de Orochimaru. Quando ainda era criança, um oficial‑chefe da Unidade Médica de Konoha o encontrou; levou-o à vila e o adotou. Depois passou a atuar como espião para diversas nações e grupos, inclusive a Akatsuki, até se submeter à tutela de Orochimaru.

Utilizando essas conexões, Kabuto recolhia dados para Orochimaru, infiltrando‑se nos exames Chūnin como um shinobi de Konoha e observando os demais competidores. Embora pareça leal ao mestre, sua verdadeira natureza oscila entre um jovem gentil e um indivíduo perverso que adora enganar mentalmente os adversários.

Ele costuma seguir as instruções de Orochimaru, mas não hesita em tratar os inimigos do mestre ou até conversar cordialmente com Naruto quando surgem oportunidades. O mestre tem dificuldade em ler a mente de Kabuto e suspeita que o jovem possa estar traindo-o.

Kabuto é um shinobi habilidoso; já foi comparado a Kakashi Hatake e demonstrou eliminar membros da ANBU sem grandes esforços. Sua força se baseia principalmente nos jutsus médicos que aprendeu com Nonou Yakushi; esses poderes foram aprimorados pela lealdade ao mestre, permitindo-lhe testar e expandir o conhecimento médico.

Ele consegue reviver células mortas em áreas específicas e gerar novas; na luta isso permite recuperação instantânea, enquanto nos experimentos prolonga a vida dos espécimes. Ainda é capaz de ressuscitar corpos mortos por curto prazo, transformando‑os em aliados ou armadilhas.

Em confronto com Tsunade, esta percebe que suas destrezas de combate e cura superam as que possuía na mesma fase da vida. Mesmo talentoso, Kabuto sentia-se apenas instrumento; então, depois da queda de Orochimaru, incorporou fragmentos do mestre ao próprio corpo para ganhar poder e autonomia. Desde então, os vestígios tentam assumir seu organismo.