Kozo Fuyutsuki ocupa o posto de segundo em comando no QG do Nerv e funciona como braço direito de Gendo Ikari. Como vice-comandante, ele costuma assumir a liderança nas operações da base sempre que Gendo se ausenta por motivos de trabalho. Além disso, Gendo delega a Fuyutsuki as tarefas mais rotineiras – reuniões do conselho municipal, papelada e afins.