Gendou Ikari ocupa o cargo de comandante do Nerv e lidera as pesquisas sobre os Evas, Rei Ayanami e o Projeto de Instrumentalidade Humana.
Ele é pai da Terceira Criança, Shinji Ikari, além de ser o guardião de Rei.
Originalmente chamado Rokubungi, ele alterou o sobrenome para Ikari após se casar com Yui.
No começo da série, Gendou é a única pessoa que mantém uma conexão efetiva com Rei.
Conforme a trama avança, seu passado inescrupuloso vem à tona.
Revela-se também a intensidade do amor que nutria por Yui.