Fergus foi um dos poucos treinadores de Pokémon capazes de atravessar a tempestade de Mewtwo e alcançar New Island, acompanhado de Ash, seus companheiros, Neesha e Corey. Quando descobriu que apenas Mewtwo havia convocado todos os treinadores para New Island, Fergus foi o primeiro a contestar, sustentando que um Pokémon não pode ser um treinador. Ele tentou empregar seu Gyarados na batalha contra Mewtwo, porém o Pokémon psíquico o venceu sem dificuldade. Como os demais treinadores de New Island, todos os seus Pokémon foram clonados por Mewtwo. Bulbapedia