Thanatos aparece como uma das divindades antagonistas no universo de *Saint Seiya*, criado por Masami Kurumada e inspirado na figura mitológica homônima. Assim como na tradição grega, ele personifica a mortalidade e é irmão gêmeo do deus Hipnos, responsável pelo sono. No mito de Kurumada, embora seja subordinado ao Imperador das Trevas Hades, detém todos os atributos divinos e se torna um inimigo jurado da deusa protetora da Terra, Atena.

Ele foi introduzido nas partes finais do arco de Hades, especificamente no volume 27. Descrito como cruel, impiedoso, odioso com os humanos, arrogante e sem hesitar em infligir a morte por capricho, Thanatos foi selado junto ao irmão pela própria Atena após ser derrotado na última batalha contra Hades, no século XVIII. Passou 243 anos encarcerecido numa caixa marcada pelo Selo de Atena; só recuperou sua liberdade quando uma jovem Pandora, de apenas três anos, abriu a caixa e lhe anunciou que a ressurreição de Hades estava próxima e que ela os serviria.

Segundo o *Pegasus Saint Seiya*, Thanatos é idêntico ao irmão Hipnos, exceto pelos olhos prateados e pelo cabelo diferente; uma estranha estrela repousa em sua testa. Ao contrário do irmão mais calmo e calculista, ele tende a perder a compostura e agir sem considerar as consequências quando tomado pela raiva. Sua morada fica na Elisão, onde passa o tempo com dezenas de ninfas e aguardando a missão que Hades lhe confia.

Thanatos ofereceu feroz oposição aos Santos de Atena quando estes tentaram resgatar sua deusa da morte certa e impedir o Maior Eclipse de Hades, que prometia erradicar a humanidade. Seu dever é levar a morte a todos os seres vivos quando seu tempo chegar ou como retribuição divina.

Antes da adaptação anime, ele já figurava na abertura do arco Inferno (episódios 128 em diante), ao lado de Hipnos e ofuscado por Hades. Sua aparência completa foi revelada no anime em 2008, nos episódios finais que adaptam os dois últimos volumes do mangá (volumes 27 e 28). Desde o episódio 142, a silhueta na abertura já mostrava suas características distintas.