Yuuna é uma aluna do ensino fundamental que mora em uma ilha fictícia na costa de Okinawa chamada Izayoi. Lá, ela aprendeu e praticou karatê, levando uma vida bem normal, embora precise lidar com pequenos problemas enquanto vive com sua avó, Obaa. Um dia, porém, a jovem encontra uma criatura estranha proveniente das profundezas do espaço: Stitch.