Thundercracker foi um dos primeiros Decepticons a despertar na Terra em 1984. Depois de ficar adormecido por quatro milhões de anos, ele assumiu a mesma aparência terrestre que Starscream e Skywarp, e normalmente se aliava a eles durante os ataques.

Embora seja um dos Decepticons originais e apareça em várias batalhas entre 1984 e 1985, Thundercracker teve poucos papéis proeminentes. Frequentemente cansado da autoimportância de Starscream e buscando glória, ele parecia não gostar de Starscream e das estratégias usadas para minar sua autoridade, como deixar o Autobot Skyfire destruir uma de suas armas secretas apenas para que Starscream tomasse a culpa.

Em 2005, Thundercracker participou da batalha pela Autobot City e foi morto por Optimus Prime. Com a subsequente derrota de seu líder Megatron, os Decepticons foram forçados a recuar. No entanto, havia muitos Decepticons a bordo da Astrotrain, que serviu como veículo de fuga improvisado; Thundercracker estava entre aqueles poucos Decepticons muito enfraquecidos para lutar que permaneceram na embarcação.

Expulsados para o espaço, os Decepticons danificados foram em direção a Unicron, e o corpo de Thundercracker foi usado para criar Scourge, um dos novos guerreiros de Galvatron. No episódio da terceira temporada, "Starscream's Ghost", Thundercracker parece ter uma sepultura, ou pelo menos um marcador comemorativo, na cripta Decepticon.