Freya aparece pela primeira vez no capítulo 1. Ela é uma deusa de alto escalão que costuma aparecer ao lado do Senhor Odin. Quando Odin convoca Lenneth para assumir o manto como Valquíria, Freya restaura esse poder. Em seguida, ela leva Lenneth a Midgard para familiarizá‑la com os dons da Valquíria e com o mundo em geral. Apesar de ser a primeira vez que Freya visita Midgard, ela parece ainda mais sábia.

No final do capítulo 5, enquanto Lenneth é assombrada por fragmentos vagos de sua vida humana, Freya conversa com Odin e lhe informa que o primeiro selo sobre Lenneth está enfraquecendo. É nesse momento que vemos pela primeira vez a natureza fria de Freya e como ela e Odin manipulam Lenneth Valkyrie.

A próxima vez que Freya aparece é no capítulo 11, quando sua irmã mais nova, Frei, é morta por Loki. Ela sente a onda de energia de Frei desaparecer e fica alarmada. Odin a impede de se deixar atrair por essa possível armadilha. Em seguida ele pede que Freya fuja e lidere os Aesir caso ele caia; ela recusa, proclamando que não deixará seu lado. Ele percebe o sentimento nela e comenta sobre a beleza das palavras dela. Quando Loki interrompe a conversa, Odin novamente ordena a Freya que saia, e vemos mais tarde Freya sofrendo enquanto seu corpo é coberto pelo Senhor Odin.

Lenneth Valkyrie, a caminho de confrontar Loki, passa por Freya. Lenneth questiona por que Freya pode chorar por Odin e não pelos humanos, apontando a arrogância de Freya em relação aos mortais. Frustrada com a falta de empatia ou vontade de Freya em simpatizar com os humanos, Lenneth deixa Freya para suas tristezas.

Freya surgiu originalmente em Valkyrie Profile (PlayStation) e aparece também em Valkyrie Profile 2: Silmeria (PlayStation 2). Ela faz uma aparição em Star Ocean até o fim dos tempos.