Ele foi o primeiro humano nascido e criado em Ismo. Enquanto morava na aldeia, era conhecido como o criador de problemas do grupo. Entre os pares, ganhava respeito como líder, mas nunca se entregava a eliminar o mal – seja por boas ou más intenções. Quando descobriu Susanoo e empregou os poderes destrutivos do Mech para derrotar inimigos que atacavam a aldeia, os moradores baniram o Mech, culpando‑o pela desgraça que se abateu sobre eles. Incapaz de lidar com a superstição dos aldeões, Yamato decidiu partir junto ao melhor amigo para explorar o mundo. Em sua curta jornada, conheceu Oto e formou novos laços, tanto amigos quanto inimigos. Após vencer Orochi, deixou Susanoo onde um dia repousara nas cavernas e voltou visitá‑lo para conversar. Como não há epílogo, presume‑se que Yamato ainda causará problemas na aldeia como costumava fazer. Também se acredita que ele acabaria com Oto e começaria uma vida juntos na vila. Em “Depois da Guerra”, Yamato foi chamado novamente para pilotar Susanoo quando um fragmento do Dark Sky Carriage caiu perto da aldeia, revelando Shuranoo. Quando Yamato recusou lutar contra Shuranoo – que estava possuído por Mikazuchi – este impiedosamente cortou Susanoo e o enviou ao lago, onde foi resgatado e curado pelo Transportador de Dragão. O renovado Susanoo partiu em busca de Oto, sequestrado por Shuranoo. No clímax, Yamato pretendia se sacrificar junto a Oto (de bom grado) para derrotar Tsukiyomi ao voar rumo ao sol. Antes de atingirem o ponto de fusão, Mikazuchi apareceu e disse que pilotaria Susanoo, enquanto sugeriu que Yamato e Oto continuassem suas vidas. Lágrimas escorreram dos olhos de Yamato enquanto Susanoo lhe lançava um último olhar antes de partir em direção ao sol, destruindo a si mesmo e Tsukiyomi.