O Sr. Stein, chamado no Japão de Professor Kouji Satou (Satō Kōji), aparece apenas na terceira temporada como docente da Academia de Duelos, embora flashbacks mostrem sua presença já no primeiro ano, quando Chumley faz uma aparição. Ex‑duelista da Liga Pro que veio de família pobre, o Sr. Stein guarda rancor contra Jaden por ter enfraquecido o interesse dos demais estudantes em suas palestras, resultado da postura preguiçosa do garoto nas aulas. Em um episódio ele duplicou o D, mas adoeceu antes de concluir o jogo – isso porque foi forçado a estudar para se tornar professor e ficou tão exausto que não conseguiu continuar. Nos flashbacks, quando Stein deixou de duelar profissionalmente, Scar‑Knight evoluiu para uma versão amarga e endurecida de si mesmo, gerando o Scab Scar‑Knight separado. Ele impede Jaden de alcançar o Professor Viper no laboratório onde o macaco Wheeler foi treinado, mas é derrotado. Depois, ao tentar pegar seu precioso cartão Scar‑Knight, ele aparentemente cai no abismo. Na versão inglesa, ele é uma paródia de Ben Stein, especialmente lembrando o papel do ator na comédia “Ferris Bueller: Um Dia Fora da Escola”.