Jean Louis Bonaparte, chamado de Napoleão na versão japonesa original, aparece como personagem recorrente. Seu caráter é inspirado em Napoleão I. Na dublagem inglesa ele é interpretado por Mike Pollock, enquanto a voz japonesa fica com Naoki Tatsuta.

A partir da segunda temporada, Bonaparte assume o cargo de Vice‑Chanceler da Academia Duel. Ele vem de Paris, França, e já tentou demolir o dormitório vermelho Slifer em diversas ocasiões, mas foi repelido por Crowler. Mais tarde, ele duela ao lado de Crowler contra Maximilhão Pegasus pela vaga na Industrial Illusions, após ambos terem sido enganados a acreditar que haviam sido demitidos pelo Chanceler Sheppard.

Quando a Academia Duel chega a uma dimensão alternativa, Bonaparte incentiva os estudantes a resgatar seu filho Marcel do Espírito Duelo Yubel. Antes de se casar, o garoto estava sob custódia da ex‑esposa de Bonaparte. Após o retorno de Marcel, ele pede desculpas por ter negligenciado o filho e deixado a esposa em prol da carreira; os dois retornam à França ao fim da temporada.

Em ambas as versões inglesa e japonesa, Bonaparte fala francês ocasionalmente. Na versão japonesa, ele também se refere a si mesmo com o arcaico "wagahai" e costuma terminar a maioria de suas frases com "de aru". No anime em inglês, ele usa frequentemente os termos franceses “feux pas” e “au revoir”.

Bonaparte utiliza um baralho do Exército de Brinquedos que inclui cartas detalhando as conquistas de Napoleão I e sua coroação, como os monstros Soldado de Brinquedo e Imperador de Brinquedo. Embora suas cartas de soldado sejam fisicamente fracas, ele as compensa com marchas forçadas, o Fife and Drum Corps e uma variedade de cartas de armadilha.