Ex-comandante-chefe do GHQ, o General Yan lidera as forças do órgão no Japão, exceto os Anticorpos sob a liderança de Shuichiro. Embora seja pai de Daryl Yan, ele não gosta do filho, suspeitando que Daryl não seja seu filho biológico, e mantém um caso com sua secretária, Emily. Quando descobre que Shuichiro roubou o meteorito que originou o vírus Apocalipse de uma instalação do GHQ, o general coloca Shuichiro em prisão domiciliar e planeja transportar o meteorito para fora do país, na esperança de que esse gesto impulsione suas ambições políticas de se tornar presidente dos Estados Unidos. Contudo, durante a rebelião de Shuichiro e dos Anticorpos, o General Yan e sua equipe são mortos por Daryl, depois que ele descobre o caso do pai.