Kyouko Kirigiri é uma garota enigmática de cabelos prateados, cujo talento escolar permanece desconhecido. Apesar de ser distante e demorar a confiar nos outros, ela possui um olhar aguçado que percebe detalhes que os demais alunos não veem, algo que se mostra vital quando os corpos começam a aparecer. Ela orienta Naegi nas investigações e parece estar tentando recuperar algo que Monokuma lhe roubou no passado. O motivo de seu talento ser desconhecido é a amnésia que a impede de lembrar. Quando o estranho mascarado tenta matar Naegi, Kyouko consegue evitar o ataque, o que a torna suspeita quando o corpo da figura mascarada surge. Ela é executada por Monobear no final ruim, a menos que Naegi decida confiar nela. Mais tarde, ela se torna uma Super Detetive de Nível Superior e é filha do diretor da Hope's Peak. Kyouko foi a única das seis que sobreviveu ao julgamento final e escapou da escola no fim do jogo. Kirigiri é um dos cinco sobreviventes do jogo de morte final, e a última visão dela é a de dirigir a nova academia de Hope's Peak ao lado de seu novo diretor, Makoto Naegi.