Por milhões de anos, o Mestre Megatron – chamado simplesmente Megatron na dub – comandou legiões fanáticas de Destrons maus (Decepticons) em sua guerra pela conquista do Universo. Ele é uma arma viva que recebeu dezenas de modificações auto‑infligidas para aumentar seu poder e capacidade destrutiva; a única fraqueza dele é o desejo singular de escravizar o Universo. Seu intelecto, ego e habilidade de enganar são insignificantes, e ele dirige seu exército Destron com medo e força de personalidade. Determinado a vencer Galaxy Convoy (Optimus Prime) e os Cybertrons (Autobots), ele também busca as Forças Perdidas do Planeta (Cyber Planet Keys).