Exeggutor é um Pokémon alto e bípede que lembra um coqueiro ou palmeira. Seu corpo e pernas apresentam tons de castanho claro com finos anéis pretos, enquanto as patas são grossas e terminam em pés de dois dedos. Em cada pé há uma leve pata amarela na parte inferior. No topo do tronco surgem folhas finas e verdes. O Pokémon possui três cabeças redondas e amarelas que lembram cocos; cada uma exibe expressões faciais distintas. As cabeças pensam de forma independente, parecendo não se importar umas com as outras, o que faz com que produzam muito barulho enquanto falam em suas mentes. Apesar disso, elas convivem bem, nunca brigando entre si. Quando todas desejam seguir direções diferentes, o corpo fica incapaz de mover‑se. Elas também conseguem se comunicar telepaticamente e, às vezes, utilizam essa habilidade para chegar a uma decisão conjunta. Em combate, Exeggutor usa poderes psíquicos; com três cabeças ativas, seu poder é triplicado. Se alguma das cabeças crescer excessivamente, ela cai e se agrupa com outras para formar um Exeggcute. No episódio “O Começo: A Marcha do Esquadrão de Exeggutores” (EP043), o Pokémon também aparece em grupos da própria espécie, indicando que não é solitário. Foi chamado de “A Floresta Tropical Andante” ou “A Selva Andante”. Pode ficar lento em dias nublados por falta de luz solar. Como resultado de evolução via pedra evolutiva, Exeggutor raramente ocorre na natureza, embora seja encontrado em florestas e selvas.

Exeggutor possui uma forma regional: em Alola, onde há abundância de luz solar, o Pokémon cresce mais de cinco vezes maior que nas demais regiões. A região é considerada o melhor ambiente para o Exeggutor alolan. O pescoço do Alolan Exeggutor é mais fino e muito mais longo, fazendo‑o parecer um coqueiro ou palmeira tropical, ao contrário da versão kantoniana, que se assemelha a uma palma curta de deserto. Ele tem uma longa cauda afilada com duas folhas e uma quarta cabeça verde‑clara na ponta; essa cabeça extra pode agir por conta própria e defender a retaguarda. A cauda pode usar telepatia fraca para escanear a área circundante. O pescoço comprido pode ser usado como chicote, permitindo atacar inimigos com sua cabeça dura. Contudo, o pescoço também representa um ponto fraco, pois fica tonto ao balançá‑lo. A altura aumentada reduziu sua necessidade de defesa psíquica e, em vez disso, despertou poderes dracônicos, fazendo com que seus poderes psíquicos se tornem mais fracos. Entalhes antigos e murais retratam este Pokémon. O Alolan Exeggutor é considerado o orgulho da região de Alola pelos nativos, que se orgulham de sua aparência, alegando que é assim que o Exeggutor deve parecer. Sua altura extra faz dele o tipo Grama mais alto e pesado. O Alolan Exeggutor pode ser encontrado na Ilha Exeggutor, um antigo local de julgamento em Alola, que não só tem a forma de um Exeggutor, mas contém muitos Exeggutor selvagens, dando nome à ilha. Também pode ser visto no Bioma Litoral do Terário da Academia de Blueberry, onde a vida na ilha de Alola é simulada.