Considerado o capitão mais forte do Gotei 13, Yamamoto é representado como um velho com uma longa barba. Há muitas cicatrizes em seu tronco e cabeça, sugerindo inúmeras batalhas em seu passado. Ele usa o uniforme padrão do Capitão Shinigami, mas seu tamanho é muito exagerado. Além disso, ele esconde o haori nas costas ao invés de usá-lo. Apesar da velhice, ele tem um corpo muito musculoso.

Como o general de Gotei 13, Yamamoto é altamente respeitado por muitos Shinigami, mais notavelmente Komamura Sajin, que vê Yamamoto como um benfeitor que salvou sua vida. Ele tem um temperamento ardente e acredita que as leis devem ser executadas em benefício da comunidade. Despreza aqueles que quebram as regras, assim como seus colegas capitães Byakuya Kuchiki e Soi Fon.

Yamamoto fundou a Academia Shinigami cerca de 2000 anos antes da história principal de Bleach. Ele foi professor nessa academia e instruiu pessoalmente Kyouraku e Ukitake, dos quais admite estar orgulhoso. Quando eles se tornaram capitães, ele os tratou como se fossem seus próprios filhos.

Foi revelado que ele ordenou que Urahara Kisuke estabilizasse o portão Garganta para que os Capitães possam passar e enviou quatro Capitães até agora para apoiar a equipe de Ichigo. O Zanpakutou de Yamamoto é Ryuuujin Jakka (Lâmina Flutuante como Chama, Viz). É o mais velho e poderoso Zanpakutou à base de fogo e tem maior poder de ataque do que todos os outros Zanpakutou na Sociedade Soul.

Em forma selada, Ryuuujin Jakka está disfarçado de bastão de Yamamoto, que se desintegra em uma espada ao comando. Seu comando Shikai é "reduzir toda a criação a cinzas ardentes." Quando liberado, Ryuujin Jakka e a área ao redor de Yamamoto são consumidos em chamas. O poder absoluto da chama pode desintegrar quase tudo em que a espada é acenada.

Só poderosos lutadores como Kyouraku e Ukitake podem resistir. Mesmo em seu Shikai, o poder de Ryuujin Jakka é suficiente para lutar contra dois Shikai dos outros capitães simultaneamente. Suas habilidades como Shinigami são, sem dúvida, poderosas, pois ele foi capaz de trazer o tenente da 8a Divisão Nanao Ise de joelhos e imobilizá-la olhando para ela e liberando sua pressão espiritual. Ele também foi capaz de lutar ao lado de dois dos mais poderosos capitães, Shunsui Kyouraku e Jūshirō Ukitake, por um período de tempo decente sem qualquer sinal de lesão, enquanto ambos saíram com pequenas feridas.