Kimimaro nasceu no dia 15 de junho. Ele era o quinto membro do Sound Four, mas mudou temporariamente o nome do grupo para Sound Five. Os outros quatro membros originais foram forçados a aceitá-lo contra a vontade porque suas habilidades de combate superavam as deles juntos. Kimimaro era o único sobrevivente do clã Kaguya, capaz de manipular os esqueletos dos corpos deles.

O clã Kaguya foi dizimado quando atacaram Kirigakure, aparentemente sem outro motivo além do desejo de matar. Eles subestimaram as defesas do oponente e foram massacrados até o último homem, com apenas Kimimaro sobrevivendo.

Kimimaro foi referido por Orochimaru como o membro mais poderoso do clã, possuindo habilidades que até aquele clã amante da guerra temia. Por causa disso, ele ficou trancado em uma gaiola durante a maior parte da vida, sendo liberado apenas ocasionalmente quando necessário para lutar contra outros clãs.

Como muitos dos seguidores mais próximos de Orochimaru, Kimimaro foi marcado com um selo amaldiçoado que lhe dá maior poder às custas de seu livre-arbítrio. Quando em sua forma de nível 2, sua aparência é semelhante à de um dinossauro, com pele cinza escura, seis grandes espinhos ósseos na parte de trás do peito e uma longa cauda com espinhos ósseos.

Ele também possui muito controle sobre seu selo amaldiçoado, pois consegue controlar sua propagação por todo o corpo sem ativá-lo completamente. Kimimaro aparentemente foi amigo de Jugo em um momento, e seu controle sobre seu selo amaldiçoado impressionou este último. Karin afirma que Kimimaro foi o único capaz de parar Jugo sem se machucar.