Numa tarde ensolarada em seu apartamento parisiense, a assassina Mireille Bouquet recebe um e‑mail estranho de Kirika Yuumura, uma jovem estudante do Japão, convidando-a para “fazer uma peregrinação ao passado” juntos. Inicialmente achando o e‑mail bobagem, ela muda de ideia quando começa a ouvir uma música que reconhece desde a juventude. No primeiro encontro pessoal, os dois são emboscados por homens armados. Enquanto Mireille consegue evitar o ataque, descobre que Kirika é muito habilidosa em situações de combate, depois de ter matado vários atiradores sozinha. Apesar da proficiência em matar, Kirika lamenta não conseguir sentir remorso pelas vítimas. Além disso, ela aparentemente não lembra como adquiriu suas habilidades nem quem realmente é. Sentindo a história compartilhada entre eles, Mireille aceita unir forças com Kirika e juntos embarcam numa jornada para desvendar os mistérios de seus passados. Operando sob o codinome “Noir”, a frágil aliança da dupla é posta à prova enquanto começam a aceitar trabalhos, aproximando cada um deles da verdade sobre quem realmente são.
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