Na era da westernização, humanos e espíritos convivem lado a lado. A modernização do Japão já está em curso quando o Ministério dos Assuntos Espirituais é criado para lidar com incidentes misteriosos envolvendo os espíritos nacionais. O ministério reúne representantes dos mundos humano e espiritual. Zakuro, Susukihotaru, Bonbori e Hozuki são meio-espíritos que se juntam aos dois tenentes Kei, Riken e Ganryu. Essas garotas meio-espírito e os subtenentes masculinos foram designados para o Ministério dos Assuntos Espirituais em um esforço de unir forças e cumprir as tarefas que lhes forem atribuídas.
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