O filme funciona apenas como uma recapitulação da série de TV. Em 1982, um alinhamento planetário trouxe aos humanos provações que deveriam ser superadas e provocou uma convulsão na Terra. Durante o conflito, uma luz caiu sobre o recife de Myojinsho e cinco brilhos se espalharam ao redor do planeta como se fossem seguidos por algo.
Seis anos depois, em 1999, os humanos haviam desenvolvido todo o sistema solar e começaram a embarcar para o espaço sideral. O Exército de Defesa da Terra organizou um esquadrão de elite chamado Clisher para lidar com diversos acontecimentos no espaço. Myojin Takeru fazia parte dessa equipe.
Ele foi encontrado quando a luz atingiu o recife de Myojinsho. Na verdade, ele era Marte, nascido no planeta Gishin. Quando cresceu, ouviu uma voz estranha que lhe dizia para parar o avanço dos terráqueos rumo ao espaço e explodir a Terra. Marte era um dispositivo vivo enviado pelo Imperador Zure, que planejava conquistar o universo. Contudo, Marte, criado como terráqueo, rejeitou as ordens e decidiu enfrentar seu destino severo.
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