A Quinta Guerra do Santo Graal é um confronto feroz entre sete mágicos que atuam como mestres. Com a ajuda dos selos de comando, esses mestres recebem poder para comandar Espíritos Heróis conhecidos como Servos em batalha. Rin Toosaka está entre os participantes dessa competição e conta com sua Serva, Archer, ao seu lado. Ela busca alcançar o prêmio máximo – o Santo Graal, um artefato mágico que concede a quem o manipula qualquer desejo.
Shirou Emiya, colega de Rin, acidentalmente entra na disputa e passa a comandar Saber, um Servo. Enquanto enfrentam adversários em comum, os dois decidem formar uma aliança temporária para desafiar seus oponentes na Guerra do Santo Graal.
