No coração da Quinta Guerra do Santo Graal, Caster desencadeia seus planos, começando com a captura do Servo Saber de Shirou. Com a bruxa cada vez mais poderosa, Rin e Archer decidem que ela é uma ameaça que precisa ser tratada imediatamente.
Mas à medida que o equilíbrio de poder na guerra começa a mudar, o Mestre e o Servo se encontram andando em caminhos separados. Enquanto isso, apesar de perder seu servo e sofrer ferimentos graves, Shirou ignora o aviso de Rin para abandonar a batalha real e segue em frente na luta contra Caster.
Determinado a mostrar sua determinação em lutar, o potencial de Shirou para se tornar um protetor do povo é posto à prova. Em meio ao derramamento de sangue e caos, as motivações de cada Mestre e Servo são lentamente reveladas enquanto eles sacrificam tudo para surgir como o vencedor e reivindicar o Santo Graal.
