Souzou Haran era um cientista brilhante que conduzia pesquisas em Marte. Ele desenvolveu uma forma de vida ciborgue capaz de pensar por si mesma, e esses seres – chamados Meganóides – rapidamente perderam o controle, matando o Dr. Haran junto com toda a sua família, salvo apenas seu filho mais novo, Banjou Haran, que tinha 16 anos. Banjou conseguiu escapar de Marte em um foguete acompanhado pelo super robô solar Daitarn 3, construído com os metais especiais marcianos. Agora, aos 18 anos e vivendo na Terra em uma mansão luxuosa, Banjou enfrenta os Meganóides com o apoio do fiel mordomo Garrison e dos dois companheiros Reika e Beauty. Juntos, eles precisam impedir que os malvados Meganóides transformem todos os humanos em ciborgues e assim “melhorar” a raça humana.