Em 1988, uma explosão provocada por um garoto com poderes psíquicos varre Tóquio e desencadeia o que se torna a Terceira Guerra Mundial. Para impedir mais destruição, ele é capturado e mantido em custódia, nunca mais sendo ouvido. Em 2019, a cidade foi reconstruída como Neo‑Tóquio, um cenário marcado por violência de gangues e terrorismo contra o governo vigente.
Neste contexto, Shoutarou Kaneda lidera as “Cápsulas”, um bando de desajustados que percorrem as ruas em motos enormes e personalizadas, sempre enfrentando os rivais chamados “Os Palhaços”. Em uma dessas batalhas, Tetsuo Shima, melhor amigo de Kaneda, sofre um acidente envolvendo um esper que vaga pelas avenidas depois de fugir de uma instituição governamental. Esse encontro faz com que Tetsuo comece a despertar habilidades misteriosas, enquanto o governo tenta colocar o último vidente em quarentena para impedir que ele libere um poder destrutivo capaz de derrubar novamente a cidade.