Na trama, explica-se que já se passaram um milhão de anos desde que os Dino Knights derrotaram os Dragozaurs. Os Dragozaurs retornam, e um garoto chamado Kaito desperta-os novamente. A batalha entre os Dino Knights e os Dragozaurs recomeça, com os heróis tentando impedir que a força vital da Terra seja roubada.
