Black Jack é um médico não registrado, com um passado obscuro e cheio de mistérios. Ele trabalha ao lado de Pinoko, seu pequeno assistente que nutre uma enorme paixão pelo doutor, enfrentando casos médicos pouco conhecidos – às vezes estranhos, perigosos ou ainda desconhecidos. Gênio da medicina, ele consegue salvar quase qualquer paciente, desde que tenham recursos financeiros para pagar; sua reputação alcança o mundo inteiro, sobretudo entre profissionais de saúde e ciência. Embora seja um homem da razão, só aceita fatos quando os vê com seus próprios olhos, mas frequentemente se surpreende quando o amor e a natureza acabam prevalecendo sobre a lógica em sua própria vida.
