O Sargento Sagara volta à Escola Jindai para proteger a agente de guerra, Kaname Chidori, de qualquer perigo. No entanto, sua falta de habilidades sociais e experiência na vida real resulta em situações cômicas, mas perigosas, colocando em risco a vida escolar pacífica que Kaname deseja.
Enquanto Sagara continua trazendo uma grande variedade de armas para a escola como forma de resolver ameaças, reais ou falsas, Kaname luta para cumprir seu dever como vice-presidente do conselho estudantil, mantendo-o sob controle. Para garantir o sucesso de uma missão, Sagara é ocasionalmente forçado a usar a fantasia de um famoso mascote de parque de diversões chamado Bonta-kun.
Com sua perícia técnica, ele transforma o uniforme exuberante em um exoesqueleto de ponta que tem apenas uma disfunção: o tradutor de voz só pode produzir o som "mofu". Pânico de Metal? Fumoffu retrata as aventuras de Kaname e Sagara enquanto tentam viver suas vidas escolares normais apesar do caos que inadvertidamente causam.
