Shouya Ishida era um jovem selvagem que procurava vencer o tédio de maneiras cruéis. Quando a menina surda Shouko Nishimiya se transferiu para sua classe, ele e seus colegas a intimidaram sem pensar em nada além de diversão. Mas quando sua mãe notificou a escola sobre os abusos, Shouya foi escolhido como o culpado e condenado por tudo o que havia feito.
Com Shouko saindo da escola, Shouya ficou à mercê de seus colegas. Ele foi ostracizado sem piedade durante todo o ensino fundamental e médio, enquanto os professores faziam vista grossa para a situação. Agora, no terceiro ano do ensino médio, Shouya ainda é atormentado pelos erros da sua juventude.
Lamentando sinceramente suas ações passadas, ele parte em uma jornada de redenção: encontrar Shouko novamente e fazer as pazes com ela. Koe no Katachi conta a história animadora da reunião de Shouya com Shouko e suas tentativas honestas de se redimir, mas sempre assombrados pelas sombras do seu passado.