Depois de passar no exame Provisório de Hero sem problemas, Izuku "Deku" Midoriya procura por um estágio extracurricular na agência de heróis profissionais. All Might recomenda que ele trabalhe sob o antigo ajudante dele, Sir Nighteye, agora um herói famoso em si mesmo.
Enquanto isso, colegas de classe de Deku estão melhorando suas habilidades por meio de vários estágios. Por outro lado, o vilão Kai Chisaki usa seus poderes terríveis para ganhar favores no submundo criminoso. Conhecido como Overhaul, as ambições de Chisaki entram em choque com a Liga dos Vilões e seu líder, Tomura Shigaraki.
Ao trabalhar com Sir Nighteye, Deku descobre o sindicato de crimes de Chisaki e o relacionamento hostil do vilão com uma garota misteriosa chamada Eri. Com medo da segurança dela, Deku e seu superior Mirio Toogata precisam trabalhar juntos para acabar com o reino de terror de Chisaki.
