À medida que o verão chega para os alunos da UA Academy, cada um desses super-heróis em treinamento se esforça por se tornar heróis de renome. Eles vão para um campo de treinamento florestal comandado por heróis profissionais da UA, onde os alunos se enfrentam em batalha e passam por testes perigosos, melhorando suas habilidades e ultrapassando seus limites.
No entanto, sua viagem escolar é subitamente virada de cabeça para baixo quando a Liga dos Vilões chega, invadindo o acampamento com uma missão para capturar um dos estudantes. Boku no Hero Academia 3rd Season segue Izuku "Deku" Midoriya, um estudante ambicioso treinando para alcançar seu sonho de se tornar um herói semelhante ao seu modelo: All Might.
Sendo um dos estudantes apanhados no meio do caos do ataque do vilão, Deku deve tomar uma posição com seus colegas e lutar pela sobrevivência deles.
