O ano de 2006 é marcado por uma intensa discussão entre dois amigos inseparáveis no Colégio Jujutsu Prefeito de Tóquio. Satoru Gojou e Suguru Getou, confiantes em suas habilidades como jovens feiticeiros poderosos, acreditam que não há desafio grande demais para eles enfrentarem. Eles são incumbidos de entregar com segurança Riko Amanai, uma garota sensível, à entidade responsável pela essência do mundo jujutsu. No entanto, essa missão os mergulha em um turbilhão de conflitos morais que ameaça destruir a já frágil amizade entre feiticeiros e humanos comuns.
Doze anos depois, estudantes e feiticeiros se tornam a linha de frente contra o crescente número de maldições de alto nível surgidas das emoções negativas dos humanos. À medida que essas entidades crescem em poder, sua autoconsciência e ambição aumentam também. As maldições se unem para erradicar os humanos e criar um mundo composto apenas por usuários de energia amaldiçoados, liderados por um perigoso espírito antigo.
Para superar seu maior obstáculo, o feiticeiro mais forte, Gojou, eles planejam um ataque na Estação Shibuya no Halloween. Dividindo-se em equipes, os feiticeiros entram na luta preparados para arriscar tudo para proteger os inocentes e sua própria espécie.
