"Um coração crente é sua magia!" – foram as palavras que Atsuko “Akko” Kagari ouviu de Shiny Chariot, a famosa bruxa, durante uma apresentação mágica anos atrás. Desde então Akko vive com essa frase e sonha em ser uma bruxa como Shiny Chariot, capaz de fazer as pessoas sorrirem. Mesmo vindo de um passado sem poderes, isso não impede que ela se matricule na Luna Nova Magical Academy. Quando a animada Akko finalmente parte para sua nova escola, a viagem fica tudo menos tranquila; após essa perigosa jornada, ela faz amizade com a tímida Lotte Yansson e o sarcástico Sucy Manbavaran. Para seu grande prazer, ela também descobre a varinha de Shiny Chariot – a Roda Brilhante – que passa a usar como própria. Infelizmente, o tempo em Luna Nova será mais desafiador do que Akko imaginava. Ela se recusa a ficar aquém dos demais, sobretudo da auto-proclamada rival, a bela e talentosa Diana Cavendish, confiando na determinação para compensar seu comportamento imprudente e inexperiência com magia. Em uma época em que a feitiçaria está em declínio, a Pequena Bruxa Academia acompanha as escapadas mágicas de Akko e seus amigos enquanto aprendem o verdadeiro significado de ser bruxa.