Um dia, Red, garoto que sonha em embarcar numa jornada Pokémon, é convocado ao laboratório do Professor Okido. Lá, ele e seu rival Green recebem um Pokédex para registrar todos os Pokémon da região. Enquanto busca se tornar campeão com seu Charmander, Red conhece diversas pessoas, como o Velho Fuji, dono de uma casa para Pokémon abandonados, e Reina, que trabalha lá. À medida que a ameaça na jornada aumenta, ele e seu parceiro Pokémon vivenciam uma transformação inédita.
