A segunda temporada de World Trigger acompanha a organização defensiva da fronteira, chamada Border, criada para combater os ataques dos vizinhos que detêm poderes misteriosos. Osamu Mikumo, integrante da Border, forma o Esquadrão Mikumo junto com Yuma Kuga, um vizinho que ele acabou encontrando por acaso, e sua amiga de infância Chika Ametrori. Juntos, eles lutam para subir no ranking interno da Border a fim de se juntar à força expedicionária que patrulha a zona.